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Identificazione della linea cellulare e del campione

Gli STR (short tandem repeats) sono elementi di sequenza ripetitivi di 3–7 paia di basi sparsi nel genoma umano. Amplificando e analizzando questi loci polimorfici e confrontando poi il profilo STR risultante con quello di un campione di riferimento, è possibile identificare e verificare l'origine di campioni biologici come cellule o tessuti. Più loci vengono amplificati, maggiore è la potenza statistica della discriminazione.

I sistemi GenePrint® forniscono analisi STR altamente informative per l'identificazione di cellule e tessuti, l'analisi dell'identità umana e il rilevamento di campioni misti.

Introduzione all'identificazione delle linee cellulari e dei campioni

L'analisi delle brevi ripetizioni in tandem (STR) è un approccio informativo all'identificazione genetica che viene comunemente associato ai test del DNA nei laboratori forensi, ai casi di paternità e di persone scomparse. L'analisi STR viene utilizzata anche per verificare l'origine dei campioni di tessuto, autenticare le linee cellulari e rilevare le miscele di tessuti o cellule.

Il profilo STR è una procedura standard per l'autenticazione delle linee cellulari (ANSI/ATCC ASN-002). L'autenticazione delle linee cellulari offre ai ricercatori la certezza che le loro linee cellulari siano identificate correttamente e non siano contaminate da altre cellule. I principali archivi ora autenticano l'identità delle linee cellulari e molte pubblicazioni richiedono l'autenticazione delle linee cellulari prima della pubblicazione degli articoli.

L'analisi STR viene utilizzata anche per confermare l'identificazione dei tessuti. Qualsiasi incertezza sull'origine di un tessuto’deve essere risolta prima che il campione possa essere utilizzato in un esperimento. L'analisi STR è un modo semplice e veloce per farlo. I ricercatori possono confrontare il profilo STR del tessuto con quello di un campione di riferimento per determinare l'identità.

Allo stesso modo, l'analisi STR può essere utilizzata per rilevare la contaminazione del campione, che appare come un profilo STR misto. La sensibilità dell'analisi STR, che può creare profili completi da meno di 100 g di DNA, consente di rilevare quantità minime di cellule o tessuti contaminanti.